Bacillusy Pseudomonas fluorescentes de la rizosfera de agaves silvestres antagonistas contra bacterias pectinolíticas

Abstract

Pseudomonas fluorescentes y Bacillusspp. se encuentran entre las bacterias con mayor potencial para el control biológico de enfermedades en plantas. Los objetivos de esta investigación fueron: i) identificar especies de Pseudomonas fluorescentes y Bacillus de la rizósfera de agaves silvestres antagonistas de bacterias pectinolíticas, y ii) detectarla presencia de genes para la biosíntesis de lipopéptidos antimicrobianos (AMPs) en las cepas antagonistas. Se evaluó el índice de eficiencia antagonista (IEA)in vitrode 109 cepasdePseudomonasfluorescentes y 119 deBacillusspp. aisladas de la rizósfera de agaves silvestre contra cinco cepas bacterianas pectinolíticas de los géneros Pectobacterium y Dickeya. Por PCR, las bacterias antagonistas se identificaron por secuenciación del gen 16SrRNA y se detectaron los genes AMPs: fenD (fengicina), ituC (iturina), srfAA (surfactina), y bmy (bacilomicina) para Bacillusspp.; prnD (pirrolnitrina) y phlD (2,4 diacetilfloroglucinol) para Pseudomonas fluorescentes con iniciadores específicos. Los resultados del IEAin vitro resultó en la selección de 25 cepas antagonistas contra una o más bacterias pectinolítcas. La comparación de las secuencias del gen 16S rRNA identificaron 11 (44%) cepas en el género Bacillusy 14 (56%) en Pseudomonas con similitud entre el 97 y 100%. Entre las especies de Bacillus y Pseudomonas, la mayoría albergó entre dos a cuatro genes AMPs. Los genes ItuC, srfAA y phlD fueron de mayor frecuencia en todas las cepas antagonistas; en las cepas Bacillus subtilis (9B14) y Pseudomonas fluorescens (G3, D4 y H6) se detectaron todos los genes evaluados.